PFA和PTFE的性质极度的类似，，陆续的使用温度为260摄氏度，，最低的温度在零下196摄氏度，，他们的分歧在于PFA是能够进行熔融加工的，，反之PTFE不能，，这意味着PFA能够通过注塑成型、、螺杆挤压的技术加工，，PFA管的金属离子含量较低，，在较高的温度下可能维持较强的机械强度和爆破压力，，并且其化学纯度都切合FDA的要求。。PTFE固体是一种疏水的资料，，因而PTFE不会受到水分的影响，，并且PTFE的摩擦系数较低，，而PFA会更容易受到干湿交替环境下的影响，，同时在耐盐雾侵蚀的方面，，PFA的机能要优于PTFE/PFA的柔韧性和PTFE相比更好，，尤其是在管道运输的方面，，可能反复折叠，，但是渗入机能不如PTFE。。

PFA的介电常数和PTFE一样，，同时耗散系数也极度类似，，而PFA的介电强度要高于PTFE。。